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利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)發(fā)現(xiàn)治療增生性瘢痕的潛在藥物

更新時間:2025-01-22      點(diǎn)擊次數(shù):284

各位讀者好,今天為大家?guī)硪黄褂?span style=";padding: 0px;color: red">加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選增生性瘢痕治療藥物的高分文章,是由中國醫(yī)

學(xué)科學(xué)院團(tuán)隊20245月在The British journal of dermatology發(fā)表的,題為Using network pharmacology to discover potential drugs for

hypertrophic scars"。揭示了增生性瘢痕的分子發(fā)病機(jī)制并篩選了有效治療藥物。

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研究框架:

1. 提出研究問題

增生性瘢痕現(xiàn)有藥物治療效果不佳,為探索其分子發(fā)病機(jī)制并篩選有效治療藥物而開展研究。

2. 構(gòu)建研究框架

從基因模塊入手,尋找與增生性瘢痕相關(guān)的基因模塊和關(guān)鍵基因,再基于這些結(jié)果篩選化合物,通過多種實(shí)驗驗證潛在藥物的有效性。

3. 選擇研究方法

數(shù)據(jù)獲取與分析:利用NCBI Gene Expression Omnibus的增生性瘢痕轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA,計算模塊特征基因、基因顯

著性等。

富集分析:通過Gene OntologyGOKyoto Encyclopedia of Genes and GenomesKEGG富集分析,明確基因功能。

蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析:選擇特定基因構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),利用Connectivity Map數(shù)據(jù)庫預(yù)測藥物。

分子對接:對篩選出的候選藥物與關(guān)鍵蛋白進(jìn)行分子對接。

實(shí)驗驗證:包括細(xì)胞培養(yǎng)(人增生性瘢痕成纖維細(xì)胞)、實(shí)時聚合酶鏈反應(yīng)、傷口愈合實(shí)驗、CCK8細(xì)胞增殖實(shí)驗、蛋白質(zhì)印跡法以及小鼠實(shí)驗等。

4. 分析數(shù)據(jù)

對體外和體內(nèi)實(shí)驗數(shù)據(jù)采用方差分析和混合效應(yīng)模型進(jìn)行重復(fù)測量分析。

5. 得出結(jié)論

通過上述研究發(fā)現(xiàn)ITGB1TGF - β信號通路對增生性瘢痕形成非常重要,克唑替尼可作為潛在治療藥物。

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參考文獻(xiàn)

[1]Zhang Y, Li X, Yu Q, et al. Using network pharmacology to discover potential drugs for hypertrophic scars[J]. Br J Dermatol, 2024,191(4):592-604.


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